技術(shù)
導(dǎo)讀:北京2023年7月24日 -- 雖然神經(jīng)科學(xué)家已研究了數(shù)十年,但阿爾茨海默癥和帕金森癥等腦部疾病的治療方法仍舊進(jìn)展緩慢,其原因在于腦部是人體中最復(fù)雜、最難了解的器官。關(guān)于腦部研究的數(shù)據(jù)集雖然數(shù)量眾多,但卻離散多元,而且通常不能夠用統(tǒng)一的科學(xué)語言來描述。
北京2023年7月24日 -- 雖然神經(jīng)科學(xué)家已研究了數(shù)十年,但阿爾茨海默癥和帕金森癥等腦部疾病的治療方法仍舊進(jìn)展緩慢,其原因在于腦部是人體中最復(fù)雜、最難了解的器官。關(guān)于腦部研究的數(shù)據(jù)集雖然數(shù)量眾多,但卻離散多元,而且通常不能夠用統(tǒng)一的科學(xué)語言來描述。
"盡管投入了大量資金,但我們尚未找到解決主要腦部疾病的方法"艾倫研究所腦科學(xué)高級(jí)研究員Ed Lein表示,"我們擁有大量信息,但這些信息沒有經(jīng)過整合或很難綜合處理。"
在美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH)的資助和亞馬遜云科技技術(shù)的支持下,艾倫研究所正在領(lǐng)導(dǎo)腦知識(shí)平臺(tái)(Brain Knowledge Platform),以期解決這一問題。
腦知識(shí)平臺(tái)工作的一部分是繪制一張全新的、精確到單個(gè)細(xì)胞的完整腦部地圖,這項(xiàng)工作由Lein和來自世界各地的17家研究機(jī)構(gòu)的神經(jīng)科學(xué)研究人員主導(dǎo)。此外,艾倫研究所數(shù)據(jù)和技術(shù)主管Shoaib Mufti帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)與亞馬遜云科技合作,將利用這張腦圖創(chuàng)建全球最大的腦細(xì)胞開源數(shù)據(jù)庫。這是人類首次對(duì)關(guān)于哺乳動(dòng)物大腦結(jié)構(gòu)和功能的大規(guī)模數(shù)據(jù)集進(jìn)行匯編和標(biāo)準(zhǔn)化。
這個(gè)項(xiàng)目致力于更好地診斷和治療精神和神經(jīng)疾病,這些疾病影響美國(guó)五分之一以上人口,每年給美國(guó)造成1.5萬億美元的經(jīng)濟(jì)損失。
Lein表示:"化學(xué)有元素周期表,基因組學(xué)有極具變革性的人類基因組圖,神經(jīng)科學(xué)也要有類似的基礎(chǔ)資源,腦知識(shí)平臺(tái)將幫助創(chuàng)建這一資源。"
該平臺(tái)的核心是單細(xì)胞基因組學(xué)。有了測(cè)量單個(gè)腦細(xì)胞基因的新技術(shù),研究人員現(xiàn)在可以更好地了解大腦細(xì)胞的復(fù)雜性以及賦予細(xì)胞獨(dú)特功能的基因。這些高度詳實(shí)的細(xì)胞圖譜將幫助研究人員了解疾病的起源,并最終助力臨床醫(yī)生準(zhǔn)確找出阿爾茨海默癥和帕金森癥等疾病的成因。
"研究人員將通過這一知識(shí)平臺(tái)獲得現(xiàn)有基礎(chǔ)設(shè)施無法提供的新發(fā)現(xiàn)。"Mufti表示,"一旦分散的信息碎片相互連接,我們就可以將健康大腦的數(shù)據(jù)與患病大腦的信息關(guān)聯(lián)起來——這將釋放巨大潛力。"
該平臺(tái)還能關(guān)聯(lián)不同物種的腦部研究,Lein預(yù)計(jì)該知識(shí)圖譜最終將能夠整合所有哺乳動(dòng)物的生物學(xué)信息。
將腦部約2000億個(gè)細(xì)胞產(chǎn)生的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)變?yōu)榭纱鎯?chǔ)、分析和訪問的開源工具的正是云計(jì)算。基于此,臨床醫(yī)生或?qū)⒛軌蛘业侥X疾病的治療方法。亞馬遜云科技的高性能計(jì)算能力和Amazon SageMaker幫助艾倫研究所管理所有數(shù)據(jù),并且可跨多個(gè)工作負(fù)載進(jìn)行擴(kuò)展。艾倫研究所正在使用亞馬遜云科技的人工智能(AI)和機(jī)器學(xué)習(xí)(ML)服務(wù),并計(jì)劃在未來部署生成式AI,將龐大、復(fù)雜、多模態(tài)的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為洞察。
"通過亞馬遜云科技機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù),利用專門構(gòu)建的AI服務(wù),研究機(jī)構(gòu)能夠找出新的關(guān)聯(lián)和發(fā)現(xiàn)。"亞馬遜云科技非營(yíng)利健康事業(yè)董事總經(jīng)理Allyson Fryhoff表示,"艾倫研究所正在使用機(jī)器學(xué)習(xí)等先進(jìn)的云技術(shù),以經(jīng)濟(jì)高效且可擴(kuò)展的方式進(jìn)一步加速科研發(fā)現(xiàn)。他們致力于探尋人類大腦未解之謎,這樣的勇氣令我們印象深刻,我們也期待著腦研究未來能有新的突破。"
美國(guó)密蘇里州圣路易斯華盛頓大學(xué)神經(jīng)科學(xué)教授、艾倫研究所的研究合伙人David Van Essen從事大腦研究已經(jīng)50多年。他將大腦研究的加速變化比作地圖的演變。
"幾個(gè)世紀(jì)前,我們的地圖雖然五顏六色,但卻相當(dāng)粗淺,只反映出當(dāng)時(shí)人們對(duì)地球表面的認(rèn)知。那時(shí)的制圖師只是大致知道大陸和島嶼的方位,以及主要的地理和政治區(qū)域劃分,但并不十分準(zhǔn)確。"Van Essen表示,"近年來,信息爆炸以及衛(wèi)星圖像技術(shù)的進(jìn)步,使導(dǎo)航工具越來越準(zhǔn)確和方便。我們也渴望在人腦研究領(lǐng)域繪制越來越細(xì)致的地圖,使它成為治療大腦疾病強(qiáng)有力的導(dǎo)航工具。"
Lein和他的團(tuán)隊(duì)剛剛啟動(dòng)了這項(xiàng)為期五年的人腦地圖繪制項(xiàng)目,與之前的人類基因組計(jì)劃非常相似,該項(xiàng)目有可能為包括神經(jīng)科學(xué)在內(nèi)的所有醫(yī)學(xué)領(lǐng)域打開新的發(fā)現(xiàn)之門。